3月10日，2025 ASC世界大學(xué)生超級(jí)計(jì)算機(jī)競(jìng)賽（ASC25）公布了預(yù)賽成績(jī)和決賽入圍名單。依托南京大學(xué)eScience中心與信息化中心的聯(lián)合支持，在信息化中心副主任姚舸老師的全程指導(dǎo)下，南京大學(xué)隊(duì)在全球300多支預(yù)賽參賽隊(duì)伍中脫穎而出，首次成功晉級(jí)，實(shí)現(xiàn)了歷史性突破。
最終決賽名單，南京大學(xué)隊(duì)位列第12位，首次晉級(jí)
接下來(lái)，團(tuán)隊(duì)將在5月10日-14日于青海大學(xué)舉行的總決賽中，向冠亞軍、超級(jí)團(tuán)隊(duì)獎(jiǎng)、e Prize計(jì)算挑戰(zhàn)獎(jiǎng)、最高計(jì)算性能獎(jiǎng)等重要獎(jiǎng)項(xiàng)發(fā)起沖擊。
南京大學(xué)參賽隊(duì)員：
朱江云 21級(jí)物理學(xué)院
彭枳馭 21級(jí)物理學(xué)院
寧 銳 22級(jí)軟件學(xué)院
茆弘之 22級(jí)計(jì)算機(jī)學(xué)院
楊承岳 23級(jí)軟件學(xué)院
指導(dǎo)老師：
姚 舸 信息化中心副主任
本次ASC25預(yù)賽中，參賽者面對(duì)兩大挑戰(zhàn)：RNA甲基化修飾位點(diǎn)檢測(cè)和AlphaFold3推理優(yōu)化。RNA甲基化修飾位點(diǎn)檢測(cè)重點(diǎn)在于優(yōu)化mRNA上“5-甲基胞嘧啶”（m5C）修飾位點(diǎn)的檢測(cè)流程。參賽團(tuán)隊(duì)的任務(wù)不僅限于梳理操作步驟和構(gòu)建軟件環(huán)境，還需處理總計(jì)約3.4億條測(cè)序數(shù)據(jù)的三個(gè)數(shù)據(jù)集。在確保結(jié)果準(zhǔn)確無(wú)誤的前提下，追求極致的性能優(yōu)化，以期在海量數(shù)據(jù)處理中以效率制勝。AlphaFold3推理優(yōu)化則聚焦于結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)代碼的優(yōu)化工作。參賽者需將原本運(yùn)行在GPU平臺(tái)上的AlphaFold3代碼移植到CPU平臺(tái)上，并確保其高效運(yùn)行。任務(wù)要求在保持預(yù)測(cè)精度不變的情況下，對(duì)組委會(huì)指定的12組蛋白質(zhì)序列進(jìn)行快速推理。這不僅是對(duì)編程技巧的考驗(yàn)，更是對(duì)計(jì)算資源利用效率的挑戰(zhàn)。
這兩個(gè)賽題融合了高性能計(jì)算與人工智能，要求參賽團(tuán)隊(duì)充分結(jié)合軟硬件環(huán)境，通過(guò)深入挖掘平臺(tái)潛力，最大化計(jì)算性能，為解決復(fù)雜科學(xué)問(wèn)題提供強(qiáng)有力的支持。
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